Mengapa varian baru seperti Omicron bisa menyebar lebih mudah?
The Economist Explains

Mengapa varian baru seperti Omicron bisa menyebar lebih mudah?

MVIRUS UTATED yang bertahan dan berkembang disebut varian. Dalam kasus SARSCHAIV-2, virus penyebab covid-19, ini mulai menyebar dengan sungguh-sungguh pada November 2020, dengan munculnya varian Alpha, pertama kali terlihat di Inggris. Varian Delta, yang merupakan strain global dominan, pertama kali terdeteksi di India pada akhir 2020. Yang terbaru, Omicron, pertama kali diidentifikasi di Afrika Selatan pada November 2021.

The Economist hari ini

Cerita yang dipilih sendiri, di kotak masuk Anda

Buletin harian dengan jurnalisme terbaik kami

Masih banyak yang harus diketahui tentang Omicron. Meskipun bukti awal menunjukkan bahwa varian ini memang menyebar sangat cepat, lebih banyak pekerjaan diperlukan sebelum ada yang tahu apakah itu akan menggantikan Delta. Omicron memiliki sekitar 30 mutasi pada protein spike, struktur yang melapisi permukaan virus dan memungkinkannya mengunci dan memasukkan genomnya ke dalam sel manusia. Sekitar 20 mutasi lebih beroperasi pada bagian lain dari virus: beberapa di antaranya mungkin juga berbahaya. Bagaimana mutasi meningkatkan transmisibilitas?

Virus, seperti semua organisme, memiliki siklus hidup. Mereka bersifat parasit, dimulai ketika virus induk menginfeksi makhluk lain dan membajak selnya untuk membuat salinan dirinya sendiri. Dalam kasus SARSCHAIV-2, ini terjadi ketika menempel pada enzim yang disebut KARTU AS2 yang berada di membran beberapa sel manusia. SARSCHAIV-2 kemudian memasukkan genomnya ke dalam sel. Invasi seluler ini dibantu oleh protein spike. Beberapa bagian dari struktur virus lebih mampu menahan mutasi: lonjakan adalah yang paling toleran terhadap perubahan.

Sifat virus yang dapat berubah berakar pada keacakan yang melekat dalam proses menghasilkan salinan objek apa pun, membuat kesalahan tidak dapat dihindari. Saat sel inang membuat salinan dari SARSCHAIV-2, terjadi kesalahan. Sebagian besar virus tidak bertahan dari kesalahan ini dalam replikasi. Tetapi beberapa melakukannya, dan bahkan mungkin berkembang sebagai akibat dari perubahan, mengalahkan virus leluhur dan menyebar lebih efisien melalui populasi inang mereka. Varian baru harus memiliki beberapa keunggulan dibandingkan yang lama jika ingin menjadi bentuk virus yang dominan. Keuntungan itu dapat diperoleh dengan berbagai cara, tetapi untuk penyakit pernapasan seperti covid-19, salah satu faktor terpenting adalah penularan, betapa mudahnya virus berpindah dari satu orang ke orang lain.

Salah satu mutasi pertama yang meningkatkan transmisibilitas disebut sebagai n501DAN, kadang-kadang dikenal sebagai “Nelly”, salah satu dari delapan mutasi yang menjadi ciri protein lonjakan varian Alpha dan yang juga ditemukan di Omicron. Angka “501” berarti bahwa perubahan terjadi pada asam amino ke-501 dalam rantai 1.273 yang membentuk lonjakan. Urutan dan komposisi asam amino ini ditentukan oleh urutan genom yang cocok, sehingga “501” mengacu pada posisi pada genom dan posisi pada rantai asam amino. “N” adalah kependekan dari asparagin, yang di n501DAN ditukar dengan “Y”, yaitu tirosin.

Karena asam amino yang berbeda memiliki sifat kimia yang sedikit berbeda, pertukaran ini mempengaruhi struktur protein lonjakan. Ini karena cara muatan listrik didistribusikan di atasnya berubah. Itu mengubah bentuk protein sedikit, karena area muatan listrik positif menarik area muatan negatif. Berkat dinamika tersebut, n501DAN memungkinkan bagian penting dari paku untuk berputar sekitar 20 derajat, membuatnya lebih pas dengan KARTU AS2 reseptor. Pengikatan yang lebih baik terjadi sebagai konsekuensinya, yang berarti bahwa setiap salinan varian yang masuk ke dalam tubuh lebih mungkin untuk menemukan targetnya dan mulai mereplikasi. Ini meningkatkan transmisibilitas. Mutasi lain melakukan trik serupa, membebaskan bagian paku yang berbeda dengan cara yang berbeda sehingga dapat mengikat lebih efektif ke KARTU AS2.

Perubahan bentuk protein lonjakan bukan satu-satunya cara untuk meningkatkan penularan. Ravindra Gupta, ahli virologi molekuler di Universitas Cambridge, dan rekan-rekannya berpendapat bahwa peningkatan transmisibilitas Delta turun, sebagian, ke mutasi di situs 681. Ini adalah titik lonjakan di mana, setelah terikat KARTU AS2, protein terbelah dua. Dr Gupta mengatakan bahwa, antara lain, P681R, dibantu oleh dua mutasi pengubah bentuk di tempat lain, memudahkan virus untuk menyuntikkan genomnya ke dalam sel inang.

Mutasi lain membuat virus lebih mudah menular dengan membantunya menghindari antibodi yang diberikan sistem kekebalan untuk melindungi tubuh dari infeksi. Sama seperti protein lonjakan dapat digeser oleh serangkaian mutasi untuk mengikat lebih baik ke KARTU AS2, demikian juga mutasi lain dapat mempersulit antibodi untuk berikatan dengan lonjakan. Jika demikian, mereka akan kurang efektif dalam menghentikan infeksi.

Salah satu alasan para ilmuwan khawatir tentang Omicron adalah bahwa ia tampaknya memiliki ketiga jenis mutasi—serta banyak lagi yang masih belum dipahami. Hanya data lebih lanjut yang akan menunjukkan sejauh mana ketakutan mereka terbukti.

Posted By : keluaran hk 2021